Сибирское отделение российской академии медицинских наук
 
 

Итоги заседания Президиума РАН 17 мая 2016

18 Мая 2016

РАН

17 мая 2016 года

состоялось очередное заседание Президиума Российской академии наук

Члены Президиума заслушали научное сообщение «Международный проект «Протеом человека» и участие в нем российских ученых».

Докладчик — академик Александр Иванович Арчаков.

Развитие проекта «Геном человека» стало началом международного проекта «Протеом человека», старт которого объявлен 23 сентября 2010 года в Сиднее. Россия не участвовала в выполнении проекта «Геном человека», однако, была одной из шести стран-инициаторов международного протеомного проекта, цель которого более амбициозная — измерить содержание продуктов экспрессии генов (белков) в организме человека. Предполагается, что эти знания откроют новые горизонты в диагностике и лечении заболеваний.

Среди принятых международных сообществом подходов к исследованию протеома, одним из наиболее успешно развивающихся стал хромосомо- или геноцентричный подход, при котором результаты анализа белков картируются на соответствующие им белок-кодирующие гены определенной хромосомы. На сегодняшний день в выполнении проекта участвует более 20 стран (США, Канада, Корея, Китай и др.), усилия которых направлены на измерение белков, кодируемых 25 хромосомами человека (22 соматических, 2 половые хромосомы — Х иY, и митохондриальная хромосома). Российская часть проекта заключается в определении содержания белков, кодируемых генами хромосомы №18 человека, выбранной по оптимальному соотношению количества белок-кодирующих генов (их около 300) и их медицинской значимости.

Согласно утвержденной международным Консорциумом «дорожной карте» проекта, конечной целью российской части является определение размеров протеома хромосомы №18 в трех типах биологического материала — клетках печени человека, клеточной линии гепатоцеллюлярной карциномы HepG2 и плазмы крови. Размер протеома зависит от количества видов белков (ширины протеома) и числа копий каждого вида белка в биологическом образце (глубины протеома). Ширина протеома может быть рассчитана только при учете возможных модификаций белков, т.е. одно-аминокислотных полиморфизмов, вариантов альтернативного сплайсинга и пост-трансляционных модификаций. Для определения глубины протеома «дорожной картой» установлена граница чувствительности используемого аналитического метода — 10-18М, что соответствует 1 копии белка на 107 клеток печени или клеточной линии HepG2 или 1µL плазмы.

В первые пять лет реализации проекта «Протеом человека» за счет использования современных масс-спектрометрических методов российские ученые достигли наилучшей степени охвата белков, кодируемых одной хромосомой.

В обсуждении доклада приняли участие:

ак. В.П. Чехонин, ак. Л.М. Зеленый, ак. М.В. Угрюмов, ак. В.Т. Иванов, ак. А.Л. Асеев, ак. В.А. Черешнев, чл.-корр. А. В Лисица, ак. В.А. Тутельян, ак. А.И. Григорьев.

Члены Президиума обсудили и приняли решения по ряду других научно-организационных вопросов